เว๊ปไซต์ Japan Times รายงานความคืบหน้าเหตุคนร้ายวัย 24 ปี ทราบชื่อภายหลังว่าชื่อนายเคียวตะ ฮัตโตริ ได้แต่งกายในชุดโจ๊กเกอร์ ตัวร้ายจากภาพยนตร์ Batman ควงมีดทำครัวยาว บุกเข้าไปในรถไฟใต้ดิน ซึ่งกำลังมุ่งหน้าไปยังสถานีชินจุกุ กลางกรุงโตเกียว ก่อนไล่แทงผุ้โดยสารได้รับบาดเจ็บ 17 คน โดยหนึ่งในนั้นเป็นชายในวัย 70 กว่าได้รับบาดเจ็บสาหัสหลังจากถูกแทงเข้าที่บริเวณหน้าอก
จากนั้นคนร้ายก็ได้ราดน้ำมันไฟแช็คลงบนพื้นและบนที่นั่ง ก่อนจุดไฟเผา ส่งผลให้ผู้โดยสารตื่นตกใจวิ่งหนีตายกันอลหม่าน แต่รถไฟจอดไม่ตรงกับประตูสถานี ทำให้ประตูไม่เปิดอัตโนมัติ ทำให้ผู้โดยสารต้องปีนออกทางหน้าต่างรถไฟ หลังเกิดเหตุนายฮัตโตรินั่งสูบบุหรี่รอเจ้าหน้าที่มาควบคุมตัว โดยไม่มีการขัดขืนแต่อย่างใด ระหว่างการสอบปากคำนายฮัตโตริกล่าวว่าเขาต้องการฆ่าคนให้ได้อย่างน้อย 2 คนขึ้นไปเพื่อจะได้รับโทษประหาร
ผู้โดยสารที่เห็นเหตุการณ์เล่าว่า เห็นคนร้ายในชุดโจ๊กเกอร์ถือมีดติดคราบเลือดเข้ามา ทีแรกคิดว่าเป็นธีมฮาโลวีน เนื่องจากวันเกิดเหตุตรงกับวันฮาโลวีน และผุ้โดยสารส่วนใหญ่บนรถไฟกำลังมุ่งหน้าไปร่วมงานฮาโลวีนกัน ทำให้ไม่มีใครสงสัย