​นอกจากนี้ หลังจากมีคำสั่งให้ไปช่วยราชการที่ศูนย์ปฏิบัติการสำนักงานตำรวจแห่งชาติ หรือ ศปก.ตร. จนครบกำหนดเวลา 6 เดือนแล้ว กลับยังไม่มีคำสั่งให้กลับคืนสู่ตำแหน่งเดิม โดยทางต้นสังกัดอ้างว่าการสืบสวนสอบสวนทางวินัยยังไม่แล้วเสร็จ

ดร.ธนกฤตยังบอกอีกว่า ​ขณะเดียวกัน ยังมีข้อกังขาเกี่ยวกับความโปร่งใสในระบบราชการและการเลื่อนตำแหน่ง โดยตามระเบียบของคณะกรรมการป้องกันและปราบปรามการทุจริตแห่งชาติ หรือ ป.ป.ช. ระบุไว้ชัดเจนว่า ตราบใดที่ยังไม่มีมติชี้มูลความผิด ให้หน่วยงานราชการปฏิบัติตามขั้นตอนปกติ ซึ่งตามลำดับอาวุโสอันดับ 1 แพทย์ใหญ่โรงพยาบาลตำรวจควรได้รับการเสนอชื่อโปรโมตขึ้นดำรงตำแหน่งเป็น ผู้ช่วยผู้บัญชาการตำรวจแห่งชาติ แต่ในเวลาต่อมา คณะกรรมการข้าราชการตำรวจ หรือ ก.ตร. กลับมีการถอนวาระการแต่งตั้งดังกล่าวออกไป

​ประกอบกับช่วงที่ผ่านมา เริ่มมีมาตรการบีบคั้นภายในพื้นที่ เช่น คำสั่งให้ขนย้ายสิ่งของออกจากห้องทำงานทันที และข้อห้ามในการเข้าพื้นที่บางส่วนของโรงพยาบาลตำรวจ ซึ่งสร้างความอึดอัดใจให้กับหมอทวีศิลป์มาโดยตลอด

​ดร.ธนกฤต ยืนยันว่า การตัดสินใจลาออกจากราชการ ของหมอทวีศิลป์ ในครั้งนี้ เพื่อต้องการออกไปต่อสู้นอกระบบราชการที่มองว่าไม่ได้รับความเป็นธรรม โดยทีมกฎหมายได้เตรียมนัดประชุมเพื่อพิจารณาฟ้องร้องดำเนินคดีกับผู้เกี่ยวข้องทั้งหมด ไม่ว่าจะเป็นผู้บังคับบัญชาในสายงาน ประธานหรือ คณะกรรมการ ก.ตร. รวมถึงบุคคลในแพทยสภา ทั้งในทางแพ่งและทางอาญา

​พร้อมกันนี้ เตรียมนำข้อเท็จจริงเข้าสู่กระบวนการพิจารณาของศาล โดยเฉพาะประเด็นอาการป่วยและโรคประจำตัวของนายทักษิณ ชินวัตร ทั้ง 14 โรค เพื่อชี้แจงความบริสุทธิ์ใจว่าเป็นการปฏิบัติหน้าที่ตามหลักวิชาชีพแพทย์ และปฏิเสธข้อครหาเรื่องการรับผลประโยชน์ตามที่มีกระแสวิพากษ์วิจารณ์ในสังคมก่อนหน้านี้

เมื่อถามว่า ตามสายบังคับบัญชาทั้งในสำนักงานตำรวจแห่งชาติ และ ก.ตร. หมายความถึงอาจฟ้องผู้บัญชาการตำรวจแห่งชาติ และนายกรัฐมนตรี ในฐานะประธาน ก.ตร.ใช่หรือไม่ ดร.ธนกฤตบอกว่า ก็ต้องดูว่าช่วงเวลานั้น ใครเป็นผู้มีอำนาจ