โดยเฉพาะในข้อ 15 (2) กำหนดให้ผู้ต้องขังหลายคนในคดีเดียวกัน ให้แยกผู้ต้องจังแต่ละคนมิให้ปะปนกัน เว้นแต่มีเหตุจำเป็น หรือข้อกำหนดด้านสถายที่ เพื่อประโยชน์ในการควบคุมดูแล ความมั่นคง และความสงบเรียบร้อยในเรือนจำ

การที่ผู้ต้องขังในคดีเดียวกันไม่ได้ถูกคุมขังอยู่เรือนจำ หรือแดนเดียวกัน ไม่ได้หมายความว่าเป็นการเลือกปฏิบัติ หรือมีวัตถประสงค์กดดันแต่อย่างใด แต่เป็นการทำตามอำนาจหน้าที่ตาม พ.ร.บ.ราชทัณฑ์ พ.ศ.2560 ที่คำนึงถึงเขตอำนาจศาลในการกระทำความผิด ระดับความมั่นคง ความแออัดของเรือนจำ ความพร้อมของสถานที่ในการฝึกอบรบหรือรักษาพยาบาล ตลอดจนประสิทธิภาพในการแก้ไขพัฒนาพฤตนิสัยของผู้ต้องขัง และความสงบเรียบร้อยของเรือนจำ โดยมิได้มีวัตถุประสงค์เพิ่มโทษ หรือเลือกปฏิบัติต่อผู้ต้องขังรายใดเป็นการเฉพาะ